El ISDEMU cuenta con un espacio dentro cada una de las 6 sedes de Ciudad Mujer (Lourdes Colón, Usulután, Santa Ana, San Martín, San Miguel y Morazán), a través de los cuales se brinda orientación, asesoría legal y atención psicológica a las mujeres y población LGBTIQ+ que se encuentra en situaciones de violencia basada en género.
Las Unidades de Atención Especializada cuentan con equipos multidisciplinarios conformados por abogadas, psicólogas y trabajadoras sociales, quienes dan seguimiento a los casos de las salvadoreñas y se encargan de garantizar el cumplimiento de sus derechos, en conjunto con las demás instituciones del Estado que se encuentran albergadas en Ciudad Mujer.
